报告题目:从环境到疾病:先进生物信息学揭示微生物生态系统的关键作用
主讲人:殷晓乐 教授
主持人:马黎萍 教授
讲座时间:12月27日 9:30 am
讲座地点:闵行校区资环楼269室
主办单位:八叉书库
报告人简介:
殷晓乐博士2025年加入南洋理工大学土木与环境工程学院任助理教授。她博士毕业于香港大学张彤教授课题组,随后在哈佛医学院和附属医院完成人类肠道微生物组的博士后研究。她已发表42篇同行评审论文,其中包含5篇ESI高被引论文,总被引次数逾4385次,h指数为24。殷博士开发了多个生物信息学工具,包括ARGs-OAP,Sargfam等。荣获《Environmental Science & Technology》2023年度最佳论文奖。殷博士的研究聚焦于采用数据驱动方法探索微生物组、人类与环境间的复杂互作机制。通过开发先进计算工具并结合深度学习技术、大规模宏基因组分析与预测建模,解析抗生素抗性基因与病原菌的进化传播规律,同时运用前沿生物信息学技术探究微生物组在人类胃肠疾病中的作用,揭示新的致病机制以指导疾病诊断与干预策略。

报告简介:
测序与计算技术的进步凸显了微生物在环境与人体健康中的关键作用,但对抗性基因的跨生态系统传播及肠道微生物代谢在疾病中的机制仍认知不足。为此,我开发了整合机器学习、抗性基因数据库及高通量分析流程的计算工具,实现了对抗性基因的精准定量与动态监测,并应用于污水处理等多种环境。同时,通过多组学分析与数据挖掘,在原发性硬化性胆管炎和炎症性肠病患者中发现由硫代谢紊乱、牛磺酸累积及胆汁酸解偶联构成的新型致病机制,并经随机对照试验证实可通过调节膳食硫摄入改善病情。这一数据驱动框架未来可拓展至临床与环境多个领域,为理解微生物组介导的环境暴露与健康影响提供新途径,助力公共卫生干预与个性化医疗发展。

